Деятельность предприятия ведется с 1996 года. 1 апреля 2009 года ФГУП «Центр-Экспертиза» было преобразовано в Акционерное общество. Учредителем является Федеральное агентство по управлению государственным имуществом.
АО «Центр-Экспертиза» было образован в качестве Регионального аттестационного Центра специальных экспертиз ФСБ России. Сотрудники АО «Центр-Экспертиза» по поручениям УФСБ по Саратовской области проводят специальные экспертизы с целью определения возможности оформления лицензии на проведение работ, связанных с использованием сведений, составляющих государственную тайну.
Решением Межведомственной комиссии по защите государственной тайны № 431 от 14 июля 2022 года Региональный аттестационный центр специальных экспертиз Акционерное общество «Центр-Экспертиза» внесен в Перечень организаций, осуществляющих образовательную деятельность, по окончании которых выдается документ об образовании и (или) о квалификации, дающий право руководителям организаций, ответственным за защиту сведений, составляющих государственную тайну, считаться прошедшими государственную аттестацию.
Занятия проводят высококвалифицированные специалисты, работающие по направлениям защиты государственной тайны на ведущих предприятиях оборонно-промышленного комплекса, а также бывшие сотрудники Федеральной службы безопасности. Руководящий состав и преподаватели прошли подготовку в рамках дополнительного профессионального образования по программам «Педагог высшего и дополнительного профессионального образования», «Менеджмент в сфере образования», «Методист ДПО».